Hayden a un frère cadet, Jansen Panettiere. Sa mère est une ancienne actrice : Lesley. Elle entretient une relation amoureuse avec Milo Ventimiglia^[1]. Hayden est engagée dans une association pour sauver les baleines Photos de Alexandra Neldel « Save the whales ».

Hayden travaille actuellement sur son album, qui devait au départ sortir le 8 mai 2007. La sortie de l'album a cependant été repoussée plusieurs fois : d'abord pour new actu sur Vanessa Hundgens août, puis pour décembre. Elle est maintenant confirmée pour 2008. Cet album s'appellera Fallen Love. Le premier single Wake up call est sorti en juillet 2008.